Международная группа ученых улучшила сборку генома исчезающего вида жирафа

Ученые из Великобритании, Китая, Дании, США, Южной Кореи и России заново секвенировали и полностью упорядочили фрагменты генома масайского жирафа. Этот представитель африканской фауны — самое высокое животное в мире, чей вид относится к исчезающим. При помощи новейших методов секвенирования и сборки новосибирские ученые из НГУ и Института молекулярной и клеточной биологии СО РАН занимались оптимизацией генома, укладывая прочитанные фрагменты последовательно на хромосомы. Полученные данные были опубликованы в крупном научном журнале GigaScience (импакт-фактор — 7,267), куда попадают наборы данных и результаты исследований в области биологических наук.

Масайский жираф, благодаря своим размерам и росту, имеет уникальные анатомические и физиологические особенности. Они давно представляют интерес для ученых из различных областей исследования. Изучение генома жирафа Килиманджаро имеет высокую значимость: это не только позволит понять молекулярную основу уникальных адаптивных черт жирафов, но и поможет облегчить эволюционный анализ других жвачных животных.

— Сборка генома масайского жирафа представляла собой так называемую «кучу рваного текста» без начала и конца, как это обычно бывает для геномов других видов. В  результате четырехлетней работы у нас получилась «книга про жирафа», где определены последовательности для 20 тысяч генов. Дальше будут попытки понять, как эти гены работают, например, за счет  каких изменений в них сердце жирафа способно гонять кровь на такую  высоту, обходясь без инфарктов. Кроме того, жирафы — совершенно отдельная  группа парнокопытных, и мы выяснили в деталях, чем их геном отличается от  геномов коров, оленей и других изученных видов отряда , — рассказал руководитель научного направления ИМКБ СО РАН, инженер лаборатории структурной, функциональной и сравнительной геномики Факультета естественных наук НГУ, доктор биологических наук Александр Графодатский .

В ИМКБ СО РАН собрана уникальная коллекция живых клеток сотен видов животных планеты, в том числе африканской фауны. Сборка подобного генома — это важнейший ресурс, который может помочь сохранить масайского жирафа. Его численность сократилась на 52  % за последние годы.

— В мире сейчас есть несколько проектов нового секвенирования геномов позвоночных. От России только наш коллектив принимает в них участие. Естественно, на первом этапе выбирают зверей «звучащих», жираф — один из них , — утверждает Александр Графодатский .

Последние новости Новосибирской области по теме:
Международная группа ученых улучшила сборку генома исчезающего вида жирафа

- Новосибирск
Сборкой генома исчезающего масайского жирафа занимаются новосибирцы в составе международной группы ученых.
09:04 14.08.2019 Сибкрай.ru
- Новосибирск
Ученые из Великобритании, Китая, Дании, США, Южной Кореи и России заново секвенировали и полностью упорядочили фрагменты генома масайского жирафа.
12:20 13.08.2019 Газета Навигатор
Международная группа ученых улучшила сборку генома исчезающего вида жирафа - Новосибирск
Ученые из Великобритании, Китая, Дании, США, Южной Кореи и России заново секвенировали и полностью упорядочили фрагменты генома масайского жирафа.
08:42 13.08.2019 НГУ
 
По теме
Дорогами древних - Газета Ведомости Последние находки новосибирских археологов: бусины из скорлупы вымершего азиатского страуса, погребальные колоды в виде лодки,
21.08.2019
Обучение граждан предпенсионного возраста объявил ЦЗН Бердска - Бердск-Онлайн.Ru Автор:  Редактор. Фото pixabay.com В период обучения выплачивается стипендия в размере МРОТ - 13536 рублей Важной мерой поддержки людей предпенсионного возраста является возможность прохождения профессионального обучения.
21.08.2019
 
Помещения ЦДТ на Приморской отремонтируют за 16 миллионов рублей - Газета Навигатор Такая сумма необходима согласно проектно-сметной документации. «Добро» на проведение ремонта получено, после конкурсных процедур по определению подрядчика можно будет приступать к работам.
21.08.2019
Федеральная служба по надзору в сфере образования и науки завершила сбор и анализ предложений по совершенствованию ЕГЭ, которые поступили от участников экзаменов,
21.08.2019
Дорогами древних - Газета Ведомости Последние находки новосибирских археологов: бусины из скорлупы вымершего азиатского страуса, погребальные колоды в виде лодки,
21.08.2019 Газета Ведомости
Помещения ЦДТ на Приморской отремонтируют за 16 миллионов рублей - Газета Навигатор Такая сумма необходима согласно проектно-сметной документации. «Добро» на проведение ремонта получено, после конкурсных процедур по определению подрядчика можно будет приступать к работам.
21.08.2019 Газета Навигатор
О профилактике наркомании говорили в НГУ - Газета Навигатор Вопросы профилактики наркомании среди школьников и студентов обсудили на очередном заседании городской антинаркотической комиссии, которое прошло в Новосибирском государственном университете.
21.08.2019 Газета Навигатор
1 сентября в микрорайоне «Стрижи» откроется обновлённая школа №51 В новом учебном году 1 400 учеников школы №51 будут заниматься в одну смену.
20.08.2019 Газета Ведомости
Как под копирку: обрушение крыши дома на 2-й улице Шевцовой в Новосибирске повторило ЧП 2014 года - ГТРК Новосибирск В ночь на 21 августа в доме №20 по 2-й улице Шевцовой в Заельцовском районе областной столицы произошло обрушение крыши двухэтажного жилого дома 1959 года постройки.
21.08.2019 ГТРК Новосибирск
Игры разума - Газета Ведомости Документальный фильм о великих художниках, страдающих душевными болезнями, новая экскурсия Музея Новосибирска и другие события недели.
20.08.2019 Газета Ведомости
Нажмите для предварительного просмотра изображения - Федерация Самбо Уважаемые офицеры!  С праздником вас, с профессиональным Днем!  Ваш образ — это образ великого воина, утверждающего в мире устои нравственности, свободы, любви к родной земле и своему народу.
21.08.2019 Федерация Самбо
Армейские испытания впервые проходили в индийской пустыне Тар. В них участвовали восемь команд – из России, Армении, Белоруссии, Индии, Казахстана, Китая, Судана и Узбекистана.
19.08.2019 Газета Навигатор
Open space picnic проходит в НГУ с 2015 года. Научный пикник завоевал популярность у зрителей – гостями мероприятия под открытым небом ежегодно становятся больше тысячи человек.
21.08.2019 Министерство образования
В текущем месяце инспекторы Управления Россельхознадзора по Новосибирской области в пункте пропуска через государственную границу аэропорта «Толмачево» проконтролировали два случая перевозки зоопарковых животных из МУП «
21.08.2019 Федеральная служба по ветеринарному и фитосанитарному надзору