В Новосибирске ученые обсудят проблемы "цифрового фундамента" научной и клинической медицины

Мы продолжаем знакомить вас с темами, которые будут обсуждаться на  международной мультиконференции BGRS\SB’2018 в Новосибирске 20-25 августа 2018 года.

 


Сегодня практически все технологии, которые используются и в исследовательской биологии и клинической медицине опираются на компьютерную обработку и анализ данных. Мощность исследовательского оборудования и систем мониторинга растет в геометрической прогрессии. И вместе с ней растет объем получаемой исследователем информации.

 

Еще несколько десятилетий назад первичным результатом МРТ исследования  головного мозга был пакет файлов в сто килобайт и меньше, то сейчас для того, чтобы записать полный протокол такого исследования нужно иметь десятки гигабайт памяти на DVD-диске. Рутинными материалами для исследователей стали видеоконтроль за подопытными животными, цветные микрофотографии с высоким разрешением, работа с цветовыми маркерами, видео-файлами.

 

А в совокупности получается гигантский массив информации об объекте исследования, который с полным правом можно отнести к Big data.

 

"Но сейчас, когда на нас накатывается такой огромный объем данных, остро встает вопрос, как эту информацию быстро обрабатывать, корректно анализировать и потом синтезировать полученные данные в объективный результат", - отметил заместитель директора Института цитологии и генетики СО РАН, доктор медицинских наук Андрей Летягин.

 

Ученые признают, часто речь идет об информационных массивах, проанализировать которые в разумные сроки не под силу даже самому квалифицированному специалисту, требуется привлечение искусственного  интеллекта. С другой стороны, такая обработка дает очень важные  результаты, которые вызывают не только академический интерес, но и имеют  сугубо практический характер.

 

Так, по результатам мониторинга уровня глюкозы в крови в течение нескольких суток были выявлены его провалы, которые происходят у ряда людей во время сна по определенным биологическим ритмам и даже могут повлечь внезапную смерть. Обладая такой информацией, врачи получают возможность купирования этой угрозы здоровью. И это только один из многих примеров тех возможностей, которые открываются перед медициной  вместе с развитием систем диагностики и мониторинга состояния разных систем организма.

 

Вопросу инструментария для работы с Big data (большими базами данных) в области биомедицины и тем возможностям, которые при этом открываются для диагностики и лечения заболеваний, будет посвящено несколько докладов на "Sbiomed-2018" -медицинском симпозиуме, проходящем в рамках BGRS-SP. 

На основе анализа данных (в том числе, косвенных), строится индивидуальная модель пульсовой кривой, для поиска среди ее характеристик различных биомаркеров.

 

"Основная наша цель: найти биомаркеры, которые характеризуют состояние  лимфатической системы и лимфотока в определенной части организма  пациента", - рассказал Андрей Летягин.

Эти параметры очень важны для выбора стратегии лечения такой патологии  как лимфедема. Она проявляется в нарушениях оттока жидкости по  лимфатическим сосудам, ведущим к нарастающим отекам мягких тканей пораженной области. Однако такие нарушения могут быть вызваны разными причинами и развиваться по разным механизмам, соответственно, и лечение их должно быть совершенно разным. В одном случае требуется физиотерапия, в другом - компрессионное бинтование, в третьем - воздействие на отдаленные лимфоузлы, в четвертом – затрагивать венозную систему.

 

Еще больше усложняют картину участие в развитии заболевания различных генетически обусловленных и внешних факторов. Распутать этот узел ученые рассчитывают с помощью разрабатываемой модели, где на основе найденных биомаркеров можно оценить происходящее на микроциркуляторном и клеточном уровнях. Зная механизм развития патологии в каждом конкретном случае, уже можно планировать индивидуализированную, правильную и наиболее эффективную стратегию лечения. Конечно, такая работа снова потребует обработки объемов информации, попадающих под определение Big data, а значит, в перспективе к ней надо будет привлекать системы искусственного интеллекта. А в результате, формируется та самая персонализированная медицина, о необходимотсти внедрения которой сегодня говорят повсеместно.

 

Напоминаем, что ведущие участники этого проекта примут участие в работе 11-й международной конференции по биоинформатике регуляции и структуры геномов  и  системной  биологии (Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology - BGRS\SB-2018), которая пройдет в новосибирском Академгородке 20-25 августа 2018 года.

 

Георгий Батухтин.



 
По теме
С 1993 года мэрия Новосибирска оказывает материальную поддержку лучшим аспирантам, студентам и студенческим семьям Новосибирска, обучающимся в системе как высшего, так и среднего профессионального образования.
21.11.2018
 
Обучающий семинар «Реализация государственной национальной политики в субъектах Российской Федерации» пройдет в Новосибирской области 27-29 ноября.
21.11.2018
Сибирские ученые изучают Землю - Газета Бумеранг В Академгородке открылась IX Сибирская конференция молодых ученых по наукам о Земле Сибирские конференции молодых ученых регулярно проходят в новосибирском Академгородке, начиная с 2002 года.
21.11.2018 Газета Бумеранг
Открыть оригинальное изображение - Министерство образования 15 ноября 2018 года в городе Куйбышеве в рамках деятельности управления образовательной политики регионального министерства образования и Областной методической службы в сфере образования Новосибирской области прошли сем
21.11.2018 Министерство образования
В день рождения двух Михаилов – Ломоносова и Лаврентьева – в Академгородке традиционно проходит таинство посвящения, после которого просто ученики СУНЦ НГУ становятся физматшкольниками.
19.11.2018 Газета Навигатор
После аварии на месте видели три экипажа скорой помощи - НГС.Новости После аварии на месте видели три экипажа скорой помощи Утром в среду, 21 ноября, автобус ПАЗ врезался в стоявшую у обочины фуру на дороге под Новосибирском — на месте работало несколько машин скорой помощи.
21.11.2018 НГС.Новости
Стянули силы из разных районов города: в поселке Красный Яр локализовали крупный пожар в садовом обществе - МЧС Новосибирской области Крупный пожар в садовом товариществе в Новосибирской области перекинулся на несколько строений, во время тушения произошел взрыв газа, с огнем боролись более 20 человек.
21.11.2018 МЧС Новосибирской области
Все произошло на остановке общественного транспорта на улице Российской в микрорайоне Щ. Как рассказывают очевидцы происшествия, дедушка ждал автобус на остановке общественного транспорта «ГПТУ -55».
21.11.2018 Газета Навигатор
Артем Находкин.JPG - Газета Бумеранг Детский репертуар «Красного факела» пополнился спектаклем о приключениях Красного Шарика 15 ноября маленьким зрителям и их родителям Новосибирский государственный академический театр «Красный факел» подарил удивительн
21.11.2018 Газета Бумеранг
А1.jpeg - Газета Бумеранг Театральный семейный проект стартовал в Новосибирске 13 ноября в Новосибирском областном театре кукол было положено начало необычному театральному проекту, в который входят спектакли на психологические темы.
21.11.2018 Газета Бумеранг
У книжной полки - Газета Бумеранг Уважаемые читатели, представляем вашему вниманию новинки художественной литературы, поступившие в муниципальные библиотеки Советского района.
21.11.2018 Газета Бумеранг
Директор ДК «Приморский» победила в региональном конкурсе руководителей Лариса Фишер, директор МБУК ДК «Приморский», что на ОбьГЭСе,
21.11.2018 Газета Бумеранг
+ взять.jpg - Газета Бумеранг Прекрасно, когда складываются добрые традиции. В субботу, 17 ноября, уже во второй раз в атриуме нашего ТРК прошли состязания по греко-римской борьбе на приз «Эдема».
21.11.2018 Газета Бумеранг
Лилия Некрасова - Законодательное собрание Строительство современного спортивного комплекса в Сузуне проходит под контролем и при полной поддержке депутатов Законодательного собрания.
20.11.2018 Законодательное собрание
«Кубок Первой Сборной» - Газета Бумеранг На ОбьГЭСе пройдет Фестиваль боевых единоборств, посвященный 100-летию Военной Контрразведки 24-25 ноября ДЮСШ «Энергия» состоится II фестиваль боевых единоборств «Кубок Первой Сборной»,
21.11.2018 Газета Бумеранг
Первенстве Новосибирской области по баскетболу среди девушек 2005-2006 г.р.
21.11.2018 Газета Бумеранг
Фестиваль проводится в 37-й раз. Его организаторы – министерство культуры Новосибирской области, Областной центр русского фольклора и этнографии, управление культуры Искитимского района, творческая мастерская «КрАсота»,
21.11.2018 Газета Навигатор
Оповещение о начале публичных слушаний  по проекту решения о предоставлении разрешения на отклонение  от предельных параметров разрешенного строительства,  реконструкции объектов капитального строительства - Администрация Новосибирского района На публичные слушания представляется проект решения о предоставлении разрешения на отклонение от предельных параметров разрешенного строительства,
21.11.2018 Администрация Новосибирского района
Стянули силы из разных районов города: в поселке Красный Яр локализовали крупный пожар в садовом обществе - МЧС Новосибирской области Крупный пожар в садовом товариществе в Новосибирской области перекинулся на несколько строений, во время тушения произошел взрыв газа, с огнем боролись более 20 человек.
21.11.2018 МЧС Новосибирской области
Владислав Наумов сделал хороший силовой приём в матче 12 ноября Континентальная хоккейная лига посчитала, что силовой приём хоккеиста новосибирской «Сибири» Владислава Наумова попал в топ-10 за неделю.
21.11.2018 НГС.Новости